Un atelier de deux semaines s’est tenu au Centre Hospitalier Universitaire de Bouaké du 15 au 28 juin 2019 en collaboration avec le Professeur Chantal Akoua-Koffi pour améliorer la qualité des données sur l’identification bactérienne et la résistance aux antimicrobiens (AMR) ainsi que la collecte et l’analyse épidémiologique générale des données. La formation était destinée aux membres de l’équipe d’étude de l’ANDEMIA et du projet ARGOS financé par le BMG dans le cadre du Programme de protection de la santé mondiale (GHPP). Plusieurs membres de l’équipe d’étude ivoirienne ont participé à l’atelier ainsi que deux participants du Burkina Faso et de la République démocratique du Congo qui se sont déplacés pour prendre part à la réunion. Deux participants de RKI, Allemagne, ont également aidé à animer l’atelier, qui était parrainé par des fonds du GHPP du ministère allemand de la Santé.

Les modes opératoires normalisés pour les tests de bactériologie et de résistance aux antimicrobiens ont été examinés en détail, révisés et harmonisés conformément aux normes internationales et aux pratiques de laboratoire dans chacun des pays de l’étude. Une évaluation des risques en laboratoire a été effectuée et les résultats ont servi à créer un plan de contrôle de la qualité avec des objectifs, un calendrier et des critères concrets. Une formation a été donnée sur WHONET et un modèle a été pratiquement développé pour enregistrer et analyser les résultats en cours des activités de contrôle de la qualité. Enfin, un plan a été élaboré pour les prochaines étapes au cours des six prochains mois afin d’améliorer l’échange sur les résultats des tests de bactériologie et de résistance aux antimicrobiens dans le réseau.

Afin d’améliorer la qualité générale de la collecte des données épidémiologiques, un nouveau processus de notification a été examiné avec tous les pays, y compris un processus de validation de toutes les données antérieures et des rapports hebdomadaires permanents sur la gestion des données pour détecter et corriger plus efficacement les erreurs dans la collecte et la gestion des données. Les possibilités futures de téléconférences régulières ou de formation en ligne ont également été discutées.

Du 7 au 23 mai 2019 s’est tenu à l’Institut national des maladies transmissibles (NICD) de Johannesburg un cours d’épidémiologie et de statistique avancées. Le cours a été donné par le Dr Matthias Borchert (RKI Berlin). Au total, 14 participants de la RDC, du Burkina Faso, de la Côte d’Ivoire, de la Sierra Leone, de la Guinée et de l’Afrique du Sud ont participé au cours de 15 jours pour apprendre et appliquer les méthodes statistiques avancées et pratiques utilisées en épidémiologie. Le contenu de la formation comprenait l’analyse de régression, la gestion avancée des données et l’analyse des études cas-témoins, ce qui a été enseigné pendant les cours magistraux, les séances interactives et de groupe, ainsi qu’un volet travail et examen écrit.

Juste après, du 27 mai au 6 juin 2019, un deuxième atelier sur le thème “Biologie Moléculaire” a été donné au NICD, organisé par nos collègues de l’UP et du NICD. Au total, 9 candidats des 4 pays ANDEMIA ont participé à l’atelier.
Au cours d’une formation pratique, les participants ont traité des échantillons cliniques humains de patients ANDEMIA d’Afrique du Sud et de souches ou témoins isolés. L’objectif de la formation était d’améliorer les compétences en techniques moléculaires pour chacun des 3 syndromes ANDEMIA, comme la PCR multiplex en temps réel et l’application d’un macroarray, ainsi que les bonnes pratiques de laboratoire, l’interprétation des résultats, le stockage des données et le contrôle qualité.

En coopération avec le Programme de protection de la santé mondiale, nous avons invité trois étudiants ANDEMIA de Côte d’Ivoire, du Burkina Faso et de la République démocratique du Congo à un atelier intensif de deux mois (03.09.2018 au 26.10.2018) sur le diagnostic moléculaire à Berlin.

En plus des divers outils de diagnostic moléculaire, l’atelier comprenait également la documentation correcte des données, l’interprétation des résultats, le dépannage, la gestion de la qualité et des cours théoriques d’introduction au séquençage de nouvelle génération. De plus, nos étudiants ont pu participer à un cours d’anglais intensif, ce qui était particulièrement important pour nos étudiants des pays francophones.

L’atelier sera suivi de sessions de formation intensives dans les pays partenaires sous la direction du Dr Essia Belarbi, responsable du diagnostic moléculaire. L’objectif est de mettre en œuvre ce qui a été appris dans chacun des pays et d’assurer une application correcte et durable des méthodes apprises ainsi que le transfert des connaissances à d’autres personnes clés. En outre, un atelier plus court et plus spécifique sur le diagnostic moléculaire à l’Université de Pretoria est prévu pour mai/juin 2019 en Afrique du Sud.

En préparation du lancement d’ANDEMIA en Côte d’Ivoire, nous avons organisé un atelier visant à doter les deux sites urbains de Bouaké et Guiglo de l’expertise et des capacités de diagnostic nécessaires en bactériologie, avec un accent sur la culture sanguine et la surveillance de la RAM. Cet atelier a été financé par le Global health Program du ministère fédéral de la Santé de l’Allemagne. L’objectif de la formation était d’améliorer les routines pré-analytiques (échantillonnage, logistique de transport, préparation des milieux de culture), de mettre en place un système d’hémoculture semi-automatisé (BacT/Alert) à Bouaké, d’enseigner les techniques d’identification bactériologique, les tests de sensibilité aux antimicrobiens et de les interpréter en utilisant les seuils de rupture EUCAST.

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Notre atelier pratique ” Épidémiologie de terrain ” à Bouaké en Côte d’Ivoire a permis aux participants de tous les pays partenaires d’ANDEMIA d’acquérir des connaissances de base en épidémiologie et cartographie des risques, suivies d’une formation pratique à l’exemple du virus Lassa, dont la présence a été démontrée dans la partie nord de la Côte d’Ivoire.
Les fièvres hémorragiques virales, comme l’Ebola ou la fièvre de Lassa, sont responsables des épidémies en Afrique de l’Ouest et ont un impact énorme sur la santé humaine, comme le démontre la récente épidémie d’Ebola. Certains de ces virus (par exemple le virus Lassa) ont leur origine chez les animaux sauvages, par exemple les rongeurs. Les compétences épidémiologiques ainsi que les connaissances sur les interactions entre les humains et les animaux sont très importantes pour déterminer les zones à haut risque et réagir rapidement en cas d’épidémie. Cet atelier a été parrainé par des fonds du Programme de santé mondiale du ministère allemand de la Santé.