News14 Sep 2020

# Formation au diagnostic et à la sérologie du SARS-CoV-2 à l’INRB, Kinshasa

Afin de soutenir les collègues congolais dans la pandémie actuelle, une formation en laboratoire sur le diagnostic moléculaire du SARS-CoV-2 et la sérologie a eu lieu à l’INRB à Kinshasa.

Pendant un séjour de 3 semaines (05.-28.08.2020), Caroline Röthemeier du RKI, Allemagne et l’équipe congolaise d’ANDEMIA ont examiné des échantillons qui avaient été régulièrement prélevés chez les participants d’ANDEMIA depuis décembre 2019. L’ARN a été extrait de plus de 600 prélèvements nasaux/pharyngés de patients présentant des symptômes respiratoires aigus et a été testé pour le SARS-CoV-2. En outre, 480 échantillons de sérum ont été soumis à des tests sérologiques pour détecter la présence d’anticorps à long terme (IgG) contre le SARS-CoV-2. Les échantillons séropositifs seront désormais testés par un test de neutralisation au RKI.

Le personnel local formé par Mme Röthemeier est maintenant également responsable de l’analyse dans le cadre d’une étude sur les anticorps du SARS-CoV-2 chez les travailleurs de la santé et leurs familles à Kinshasa. Cette étude est réalisée en coopération entre le RKI, l’INRB/Kinshasa, l’IMT/Anvers et l’IRD/Montpellier.

Cette formation a été soutenue financièrement et organisationnellement par les projets ARGOS/GHPP et ZIG3/RKI respectivement.


News25 Jun 2020

# ANDEMIA et COVID-19

Le SARS-CoV-2 se répand largement sur le continent africain, et en mettant l’accent sur les maladies respiratoires aiguës, l’ANDEMIA est très engagée dans le soutien de nos pays partenaires africains dans la réponse à la pandémie.

Nous avons donc inclus la PCR du SARS-CoV-2 dans notre panel de tests de routine pour tous les patients de l’ANDEMIA (cofinancé par le BMBF par l’intermédiaire du sous-projet ANCOS), mis en œuvre des techniques de séquençage mobile afin d’étudier les chaînes d’infection, et commencé une enquête sérologique pilote pour tirer des conclusions sur le niveau d’exposition des populations locales au virus.

L’ajout de COVID-19 au programme de recherche de l’ANDEMIA permettra de combler d’importantes lacunes dans la compréhension de la dynamique et de l’épidémiologie de la maladie COVID-19, fournira une plate-forme pour la surveillance à long terme de la pneumonie COVID-19 et, surtout, apportera une aide pratique aux efforts nationaux de contrôle de COVID-19, ce qui est de la plus haute importance.


News17 Mar 2020

# Formation de mise à jour et lancement de l’enrôlement de contrôle sain, BF

Du 24.02. au 08.03.2020, trois membres de l’équipe allemande ANDEMIA de RKI ont passé deux semaines sur le site partenaire “Centre Muraz” et “Centre Hospitalier Universitaire Souro Sanou” à Bobo-Dioulasso au Burkina Faso.

Comme lors du précédent séjour en Côte d’Ivoire, le voyage s’est concentré sur le recyclage du personnel d’inscription et sur l’assurance qualité des pratiques de laboratoire. Cela comprenait des préanalyses telles que les procédures de prélèvement sanguin appropriées (vidéo de formation) et la prévention de la contamination dans l’hémoculture, ainsi que la formation individuelle et la réévaluation des pratiques de laboratoire en matière d’essais moléculaires et bactériologiques. En ce qui concerne les tests moléculaires, la validation des résultats a été réévaluée et a fait l’objet d’une attention particulière. En ce qui concerne les tests bactériologiques, l’équipe du RKI a mis l’accent sur l’utilisation des galeries API pour l’identification des bactéries avec une introduction au système APIweb. Enfin, plusieurs réunions pour le début de l’enrôlement des contrôles sains ont été organisées pour discuter des dernières questions d’organisation et pour lancer avec succès l’enrôlement au Burkina Faso.


News02 Mar 2020

# Formation de mise à jour et lancement de l’enrôlement de contrôle sain

Du 14 janvier au 13 février 2020, Essia Belarbi et Paul Pitzinger de l’équipe allemande ANDEMIA ont visité tous les sites d’étude en Côte d’Ivoire afin de former à nouveau le personnel de laboratoire aux procédés de laboratoire bactériologique et moléculaire et de mettre en place l’enrôlement de contrôles sanitaires sur les différents sites.

Les travailleurs de la santé ont reçu une formation de recyclage sur le prélèvement aseptique de sang afin de réduire les taux de contamination dans l’hémoculture, qui a été soutenue par une courte vidéo de formation, fournie par ANDEMIA et l’IMT d’Anvers. Cette vidéo est accessible gratuitement sur l’internet ici et doit être utilisée par les partenaires pour former le nouveau personnel ou pour rappeler aux travailleurs de la santé établis les techniques appropriées.

Afin d’améliorer encore la qualité des résultats bactériologiques, les biologistes et les techniciens des laboratoires de bactériologie de Bouaké et Guiglo ont été formés à l’utilisation du système API® (Analytical Profile Index). Enfin, la mise en œuvre de l’enrôlement de témoins sains a été présentée à tous les sites d’étude. Cette phase étant cruciale pour l’analyse et l’interprétation des résultats, le protocole a été discuté en détail afin de s’assurer que chaque site connaisse les procédures et puisse commencer l’enrôlement.


News10 Feb 2020

# Réunion à mi-parcours à Accra, au Ghana, Janvier 2020

Du 28 au 31 janvier 2020, les membres de l’équipe ANDEMIA ont participé à la réunion à mi-parcours du “Réseau de recherche pour les innovations en matière de santé en Afrique subsaharienne” à Accra, Ghana. Au cours de plusieurs ateliers et tables rondes, des scientifiques africains et allemands des cinq réseaux se sont réunis pour discuter des questions de santé mondiale et pour échanger leurs expériences sur des sujets communs aux projets. Des questions spécifiques aux projets ont été abordées lors de réunions internes aux réseaux.


News14 Dec 2019

# Quatrième réunion de réseau à Berlin, Allemagne

La quatrième réunion du réseau ANDEMIA a eu lieu à Berlin du 18 au 22 novembre 2019. Les partenaires de projet des quatre pays partenaires africains se sont réunis à l’Institut Robert Koch pour discuter des progrès, des problèmes et des plans pour l’avenir d’ANDEMIA. Bien entendu, les employés des projets TRICE et ARGOS du PBPE financés par le BMG, qui sont étroitement liés à ANDEMIA, ont également été invités à échanger des informations avec les partenaires du projet commun. L’un des principaux objectifs de la réunion de cette année était de planifier des analyses de données ciblées et d’élaborer un plan de publication.

Avant la réunion de réseau, trois ateliers ont été organisés à l’intention des étudiants de master et de doctorat d’ANDEMIA, ainsi que du personnel des projets ARGOS et TRICE :
Un atelier sur la “Rédaction de propositions”, visant à permettre aux étudiants de rédiger des propositions de projet structurées. Dans l’atelier “Rapport de données”, les participants ont reçu des instructions sur la compilation et l’évaluation des données de la base de données ANDEMIA. Au cours du troisième atelier, les participants ont acquis des connaissances sur le séquençage mobile à l’aide de la technologie MinION, qui doit être mise en place dans les pays partenaires en tant qu’outil de diagnostic supplémentaire.


Workshop10 Jul 2019

# Atelier sur la qualité des données à Côte d’Ivoire, 15 – 28 juin 2019

Un atelier de deux semaines s’est tenu au Centre Hospitalier Universitaire de Bouaké du 15 au 28 juin 2019 en collaboration avec le Professeur Chantal Akoua-Koffi pour améliorer la qualité des données sur l’identification bactérienne et la résistance aux antimicrobiens (AMR) ainsi que la collecte et l’analyse épidémiologique générale des données. La formation était destinée aux membres de l’équipe d’étude de l’ANDEMIA et du projet ARGOS financé par le BMG dans le cadre du Programme de protection de la santé mondiale (GHPP). Plusieurs membres de l’équipe d’étude ivoirienne ont participé à l’atelier ainsi que deux participants du Burkina Faso et de la République démocratique du Congo qui se sont déplacés pour prendre part à la réunion. Deux participants de RKI, Allemagne, ont également aidé à animer l’atelier, qui était parrainé par des fonds du GHPP du ministère allemand de la Santé.

Les modes opératoires normalisés pour les tests de bactériologie et de résistance aux antimicrobiens ont été examinés en détail, révisés et harmonisés conformément aux normes internationales et aux pratiques de laboratoire dans chacun des pays de l’étude. Une évaluation des risques en laboratoire a été effectuée et les résultats ont servi à créer un plan de contrôle de la qualité avec des objectifs, un calendrier et des critères concrets. Une formation a été donnée sur WHONET et un modèle a été pratiquement développé pour enregistrer et analyser les résultats en cours des activités de contrôle de la qualité. Enfin, un plan a été élaboré pour les prochaines étapes au cours des six prochains mois afin d’améliorer l’échange sur les résultats des tests de bactériologie et de résistance aux antimicrobiens dans le réseau.

Afin d’améliorer la qualité générale de la collecte des données épidémiologiques, un nouveau processus de notification a été examiné avec tous les pays, y compris un processus de validation de toutes les données antérieures et des rapports hebdomadaires permanents sur la gestion des données pour détecter et corriger plus efficacement les erreurs dans la collecte et la gestion des données. Les possibilités futures de téléconférences régulières ou de formation en ligne ont également été discutées.


Workshop18 Jun 2019

# Atelier statistique et moléculaire en Afrique du Sud, 7 mai – 6 juin 2019

Du 7 au 23 mai 2019 s’est tenu à l’Institut national des maladies transmissibles (NICD) de Johannesburg un cours d’épidémiologie et de statistique avancées. Le cours a été donné par le Dr Matthias Borchert (RKI Berlin). Au total, 14 participants de la RDC, du Burkina Faso, de la Côte d’Ivoire, de la Sierra Leone, de la Guinée et de l’Afrique du Sud ont participé au cours de 15 jours pour apprendre et appliquer les méthodes statistiques avancées et pratiques utilisées en épidémiologie. Le contenu de la formation comprenait l’analyse de régression, la gestion avancée des données et l’analyse des études cas-témoins, ce qui a été enseigné pendant les cours magistraux, les séances interactives et de groupe, ainsi qu’un volet travail et examen écrit.

Juste après, du 27 mai au 6 juin 2019, un deuxième atelier sur le thème “Biologie Moléculaire” a été donné au NICD, organisé par nos collègues de l’UP et du NICD. Au total, 9 candidats des 4 pays ANDEMIA ont participé à l’atelier.
Au cours d’une formation pratique, les participants ont traité des échantillons cliniques humains de patients ANDEMIA d’Afrique du Sud et de souches ou témoins isolés. L’objectif de la formation était d’améliorer les compétences en techniques moléculaires pour chacun des 3 syndromes ANDEMIA, comme la PCR multiplex en temps réel et l’application d’un macroarray, ainsi que les bonnes pratiques de laboratoire, l’interprétation des résultats, le stockage des données et le contrôle qualité.


News13 Dec 2018

# Troisième réunion de réseau à Bobo-Dioulasso, Burkina Faso

Notre troisième réunion de réseau s’est tenue du 19 au 23 novembre 2018 au Centre Muraz à Bobo-Dioulasso, Burkina Faso. Tous les partenaires ont présenté des résultats préliminaires et discuté des questions scientifiques et des difficultés organisationnelles, logistiques et de contenu, ainsi que des solutions possibles. De plus, l’ensemble des 23 étudiants de master et de doctorat inscrits au programme de formation de l’ANDEMIA ont présenté leurs projets.

L’objectif clé du réseau de la réunion était d’améliorer le nombre d’inscriptions et la qualité des données dans tous les sites et de renforcer les capacités de diagnostic bactérien dans les pays partenaires.


Workshop01 Nov 2018

# Atelier “Diagnostics moléculaire” à Berlin

En coopération avec le Programme de protection de la santé mondiale, nous avons invité trois étudiants ANDEMIA de Côte d’Ivoire, du Burkina Faso et de la République démocratique du Congo à un atelier intensif de deux mois (03.09.2018 au 26.10.2018) sur le diagnostic moléculaire à Berlin.

En plus des divers outils de diagnostic moléculaire, l’atelier comprenait également la documentation correcte des données, l’interprétation des résultats, le dépannage, la gestion de la qualité et des cours théoriques d’introduction au séquençage de nouvelle génération. De plus, nos étudiants ont pu participer à un cours d’anglais intensif, ce qui était particulièrement important pour nos étudiants des pays francophones.

L’atelier sera suivi de sessions de formation intensives dans les pays partenaires sous la direction du Dr Essia Belarbi, responsable du diagnostic moléculaire. L’objectif est de mettre en œuvre ce qui a été appris dans chacun des pays et d’assurer une application correcte et durable des méthodes apprises ainsi que le transfert des connaissances à d’autres personnes clés. En outre, un atelier plus court et plus spécifique sur le diagnostic moléculaire à l’Université de Pretoria est prévu pour mai/juin 2019 en Afrique du Sud.


News20 Aug 2018

# Visites de sites à Guiglo et Tai, Côte d’Ivoire en 2018

Depuis 2017, le Centre Hospitalier Régional (CHR) Guiglo en Côte d’Ivoire est mieux équipé en capacités de diagnostic bactériologique de laboratoire (voir rapport “Laboratoire installé à Guiglo”). En raison de cette extension de la capacité du laboratoire, d’autres diagnostics peuvent maintenant être offerts au Centre de Santé Rurale (CSR) de Tai, un petit hôpital rural près du Parc National de Tai, à une distance d’environ 80 km de Guiglo.

Le CHR Guiglo et le Centre Hospitalier Universitaire (CHU) de Bouaké ont été en constant échange de formation pour établir la méthodologie et les flux de travail nécessaires dans le laboratoire. A cet effet, plusieurs échanges de formation ont été organisés depuis mi-2017, au cours desquels le personnel du laboratoire de Guiglo a été formé pendant plusieurs semaines à Bouaké ainsi que le personnel expérimenté de Bouaké a accompagné le travail dans le laboratoire de bactério-logie de Guiglo. En avril, mai et juillet 2018, la Prof. Chantal Akoua-Koffi et le Dr Abdulaye Diarrasouba (Postdoc) ont organisé plusieurs visites à Guiglo et Tai dans le but d’établir des processus de travail dans la gestion du diagnostic en étroite collaboration avec le personnel local. Cela comprenait l’échantillonnage correct des patients, le stockage des échantillons et le traitement diagnostique à Guiglo, ainsi que le transport sûr des échantillons pour une analyse plus poussée de Tai à Guiglo et de Guiglo à Bouaké respectivement.

Grâce au projet et aux activités de formation, véhiculées par l’expertise locale, non seulement la coopération entre les hôpitaux, mais aussi les méthodes de travail internes au sein des hôpitaux se sont améliorées. Le personnel médical et de laboratoire du CHR Guiglo se réunit désormais toutes les deux semaines pour coordonner leurs activités, discuter des innovations et des problèmes concernant les projets ainsi que la routine hospitalière. Un développement similaire a déjà eu lieu au CHU Bouaké, où des représentants de tous les services rencontrent le personnel du laboratoire sur une base mensuelle. Il a été démontré qu’au cours de ces réunions, en plus des sujets pertinents pour le projet, un échange général a lieu. De tels développements peuvent contribuer à une amélioration durable de la communication même après la fin du projet et donc à la détection précoce des problèmes et à leur gestion.


News15 Mar 2018

# Deuxième réunion de réseau en Côte d’Ivoire

Notre deuxième réunion de réseau s’est tenue avec succès à l’hôpital universitaire de Bouaké en Côte d’Ivoire, le site de Prof. Chantal Akoua-Koffi, coordinatrice d’ANDEMIA. Pour cela, les équipes ANDEMIA de tous les pays se sont réunies pour discuter des progrès et des nouvelles orientations de recherche du projet.

La prochaine réunion se tiendra au Burkina Faso en novembre 2018.


News01 Feb 2018

# Lancement d’ANDEMIA à Burkina Faso

Nous avons présenté ANDEMIA au personnel médical et scientifique de l’hôpital universitaire Sourou Sanou et du Centre Muraz à Bobo-Dioulasso, Burkina Faso. Tout de suite après, les premiers patients ont été recrutés pour notre étude sur les causes des maladies respiratoires aiguës, gastro-intestinales et fébriles.


News01 Nov 2017

# Lancement d’ANDEMIA en Côte d’Ivoire

Avec un atelier d’introduction aux méthodes et protocoles ANDEMIA, une surveillance syndromique active des maladies respiratoires aiguës, gastro-intestinales et fébriles a été initiée sur les premiers sites ANDEMIA en Côte d’Ivoire – CHU de Bouaké et Centre de santé rurale de Brobo.


Workshop13 Aug 2017

Diagnostic de laboratoire – Bactériologie, hémoculture et RAM

En préparation du lancement d’ANDEMIA en Côte d’Ivoire, nous avons organisé un atelier visant à doter les deux sites urbains de Bouaké et Guiglo de l’expertise et des capacités de diagnostic nécessaires en bactériologie, avec un accent sur la culture sanguine et la surveillance de la RAM. Cet atelier a été financé par le Global health Program du ministère fédéral de la Santé de l’Allemagne. L’objectif de la formation était d’améliorer les routines pré-analytiques (échantillonnage, logistique de transport, préparation des milieux de culture), de mettre en place un système d’hémoculture semi-automatisé (BacT/Alert) à Bouaké, d’enseigner les techniques d’identification bactériologique, les tests de sensibilité aux antimicrobiens et de les interpréter en utilisant les seuils de rupture EUCAST.

Feld3

News21 Mar 2017

# Preparation du site sentinelle à Guiglo, CIV

L’un des sites sentinelles d’ANDEMIA est Guiglo, une petite ville d’environ 114.000 habitants dans l’ouest de la Côte d’Ivoire, à une distance de Bouaké d’environ 400 km. Le Centre Hospitalier Régional (CHR) est l’un des rares hôpitaux de l’ouest du pays avec une zone de couverture d’environ 30.000 km² et un taux de consultation d’environ 25.000 patients par an. Jusqu’à présent, le diagnostic en laboratoire se limite au paludisme, au VIH et à la microscopie des parasites. Le diagnostic bactériologique n’était pas possible jusqu’à présent.

La reconstruction et l’agrandissement des salles existantes ont établi les conditions de base pour la mise en œuvre du diagnostic microbiologique. La construction a commencé en septembre 2016 et s’est achevée en novembre 2016. De l’équipement essentiel et du matériel de laboratoire ont également été achetés et installés. Avec la mise en place du diagnostic bactériologique, CHR Guiglo est maintenant bien adapté pour servir de site sentinelle pour le projet ANDEMIA. La reconstruction et l’équipement ont été financés par le Ministère fédéral de la santé (Programme de protection de la santé mondiale, projet ARGOS).

La prochaine étape sera la formation des techniciens de laboratoire de la CHR Guiglo aux techniques de laboratoire microbiologique pour leur permettre d’effectuer les diagnostics essentiels. Un atelier sur l’hémoculture et les tests de résistance aux antimicrobiens devrait avoir lieu en mai 2017.


Workshop15 Feb 2017

Atelier pratique “Epidémiologie de terrain”

Notre atelier pratique ” Épidémiologie de terrain ” à Bouaké en Côte d’Ivoire a permis aux participants de tous les pays partenaires d’ANDEMIA d’acquérir des connaissances de base en épidémiologie et cartographie des risques, suivies d’une formation pratique à l’exemple du virus Lassa, dont la présence a été démontrée dans la partie nord de la Côte d’Ivoire.
Les fièvres hémorragiques virales, comme l’Ebola ou la fièvre de Lassa, sont responsables des épidémies en Afrique de l’Ouest et ont un impact énorme sur la santé humaine, comme le démontre la récente épidémie d’Ebola. Certains de ces virus (par exemple le virus Lassa) ont leur origine chez les animaux sauvages, par exemple les rongeurs. Les compétences épidémiologiques ainsi que les connaissances sur les interactions entre les humains et les animaux sont très importantes pour déterminer les zones à haut risque et réagir rapidement en cas d’épidémie. Cet atelier a été parrainé par des fonds du Programme de santé mondiale du ministère allemand de la Santé.